Secondo quanto previsto dalla L.R. n.29/2004 e successive modificazioni gli IRCCS sono dotati di un Collegio sindacale composto da tre membri, di cui uno nominato dalla Regione (con funzione di presidente), uno nominato dal Ministero dell'Economia e delle Finanze ed uno dal Ministero della Salute. Il Collegio Sindacale ha durata triennale.

La Giunta Regionale dell'Emilia-Romagna, con deliberazione n. 404 dell'11 marzo 2024, ha provveduto alla nomina del Collegio Sindacale dell'Istituto:

• Dott. Tiberio Frascari, con funzioni di Presidente
• Dott. Andrea Alessandri
• Dr.ssa Maria Rosaria Febbraro

Di questo e dei precedenti collegi sindacali sono riportati, ai sensi del D.Lgs. n.33/2013, nella sottostante sezione "Documenti", atti di nomina e rispettivi CV.